Anatomi kasar dikaji menggunakan kaedah invasif dan bukan invasif dengan tujuan mendapatkan maklumat struktur makroskopik dan organisasi organ dan sistem organ. Antara kaedah kajian yang paling biasa adalah diseksi, iaitu mayat haiwan atau mayat manusia dibuka secara pembedahan dan organnya dikaji. Endoskopi, iaitu instrumen yang dilengkapi kamera video dimasukkan melalui insisi kecil pada subjek, dapat digunakan untuk meneroka organ dalaman dan struktur hidupan lain. Anatomi sistem peredaran darah pada haiwan hidup dapat dipelajari secara tidak invasif melalui angiografi, teknik yang membolehkan saluran darah dapat dilihat setelah disuntik dengan pewarna legap. Kaedah kajian lain termasuk teknik pencitraan radiologi, seperti sinar-X dan MRI.